分子建模允许科学家使用计算机可视化分子，即以数字方式表示分子结构并使用量子和经典物理方程模拟其行为。
分子建模的目标是开发足够精确的系统模型，从而不需要物理实验。
在过去的几十年里，分子建模从可视化3D 数据库的工具得到了扩展。
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