分子生物学与方法杂志

乳腺癌患者正常组织中的合子后嵌合体突变

金龙男

尽管之前有大量研究对癌组织中的体细胞驱动突变提供了新的见解，但由突变驱动的从正常组织到癌组织的恶性转化机制仍是一个谜。在本研究中，我们对 12 例乳腺癌患者的正常和癌症配对样本进行了全外显子组分析，以阐明可能导致乳腺癌的合子后嵌合突变。我们发现正常组织中一个合子后嵌合突变 PIK3CA p.F1002C 的变异等位基因分数 (VAF) 为 2%，而匹配的乳腺癌组织中的相应 VAF 增加了 20.6%。匹配的癌组织中变异等位基因分数的这种增加可能表明嵌合突变与乳腺癌发生的根本原因有关。成熟的变异注释软件程序 SIFT_pred、Polyphen2_HDIV_pred、Polyphen2_HVAR_pred、LRT_pred、MutationTaster_pred、PROVEAN_pred、fathmm. MKL_coding_pred、MetaSVM_pred 和 MetaLR_pred 估计合子后嵌合突变是有害的。此外，我们在这些患者中发现了 61 个有害和致病突变，包括 22 个终止增益突变、12 个剪接位点突变、13 个移码突变和 7 个非同义突变。通过进行突变特征分析，我们确定了三种与乳腺癌致癌相关的突变特征，包括 APOBEC 胞苷脱氨酶和缺陷的 DNA 错配修复。综上所述，这些结果表明，除了体细胞驱动突变之外，合子后嵌合突变可能是值得在确定未来乳腺癌致病原因时优先关注的一个关键目标。