对疾病形态学方面以及亚专业的研究,可以针对特定的器官系统、不同的实验室方法和一些临床病例。胃肠道病理学;妇科病理学;心血管病理学;皮肤病理学;呼吸系统病理学;肌肉骨骼病理学;肾脏病理学、泌尿生殖病理学;内分泌病理学;眼科病理学;耳鼻喉科病理学;和神经病理学是解剖病理学研究的特定器官系统。